Просмотрел сборник эссе микробиологов Микробы и эволюция: Мир, который Дарвин не видел. История сборника такова. В 2009 году праздновалось 200 лет со дня рождения Дарвина и 150 лет со дня выхода в свет книги Происхождение видов. Микробиологи по этому поводу решили сделать коллоквиум, посвященный эволюции микробов. Для места проведения были выбраны Галапагосские острова, чтобы как можно лучше подчеркнуть роль бактерий в изучении эволюции. Далее было решено составить сборник эссе микробиологов, где ученые должны были описать источник своего энтузиазм при изучении бактерий и роль бактерий в биологической эволюции. Следует отметить, что эссе не являются научными работами, написаны в неформальном стиле и предназначены для широкой аудитории. Сборник, состоящий из 39 эссе и вводной статьи редакторов сборника, вышел в 2012 году.
Мое внимание привлекли следующие темы:
- Древо жизни, состоящее из архей, бактерий и эукариотов;
- Исследования Карла Вёзе, которые поменяли наши представления о древе жизни;
- Фаги в эволюции бактерий;
- Горизонтальный (латеральный) перенос генов;
- Мутуализм (частный случай симбиоза) в мире бактерий (князь Кропоткин был помянут добрым словом);
- Эволюционные эксперименты с бактериями;
- Секс в мире бактерий: что это такое на самом деле;
- Открытие Prochlorococcus всего 25 лет назад: микроскопический фитопланктон, который оказался крайне распространенным;
- Роль бактерий в жизни муравьев Attini, которые ухаживают за грибами;
- Обсуждение того, что такое вид среди бактерий и сложности на пути введения формального определения.
Во всех эссе микробиологов были общие черты, которые проще всего выразить статистикой употребления слов — см. таблицу ниже с наиболее употребляемыми словами в сборнике (39 эссе + одна вводная статья). Средний размер одного эссе около 2100 слов.
| Слово | Число употреблений в сборнике |
| bacteria+bacterium | 507 |
| gene+genes | 452 |
| cell+cells | 394 |
| species | 283 |
| bacterial | 261 |
| evolution | 251 |
| mutation+mutations | 245 |
| microbial | 241 |
| DNA | 223 |
| organism+organisms | 182 |
| protein+proteins | 173 |
| antibiotic+antibiotics | 170 |
| population+populations | 169 |
| life | 166 |
| microbe+microbes | 157 |
| evolutionary | 152 |
| diversity | 149 |
| genome+genomes | 148 |
| genetic | 144 |
| Darwin | 142 |
| host+hosts | 129 |
Только два микробиолога использовали термин эпигенетический и один микробиолог отметил эволюцию по Ламарку. Остальные микробиологи опирались на стандартную концепцию естественного отбора (термин естественный отбор встретился 78 раз). Несколько ярких цитат про естественный отбор:
стр. 72 ‘Таким образом, с Природой в роли музы организмы выявляют креативные решения по отношению к требованиям окружения, а естественный отбор является процессом, который в первую очередь предписывает, какие из этих требований успешно решены путем эволюции адаптивных признаков. Одна очевидная тема в эволюции жизни состоит в том, что естественный отбор часто заставляет организмы в виде креативного решения принять паразитический образ жизни.’
стр. 91 ‘В конце концов, естественный отбор адаптивных мутаций является таким же естественным как отбор адаптивных идей, только он длится дольше.’
стр. 140 ‘Биологи много знают о том, как происходит смешение и отброс — слияние яйца и спермы, молекулярный танец хромосм при разделении оплодотворенной яйцеклетки — но нам не удалось выяснить почему так происходит. Мы действительно знаем, что объяснение должно лежать в рамках естественного отбора — гены, которые заставляют нас размножаться таким путем, должны были развиться, потому что они и другие наши гены были более успешными в том случае, когда половое размножение перемешивало их с другими версиями.’
Информация
Microbes and Evolution: The World That Darwin Never Saw, Edited by R. Kolter and S. Maloy, 2012, ASM Press.
http://www.asmscience.org/content/book/10.1128/9781555818470
См. также
Есть микробиологи, которые считают, что исследования бактерий опровергают теорию Дарвина